过去，泉水为佩特拉市提供了源源不断的用水，其中最重要的泉是穆萨泉（’Ain Musa），直到今天它还在为穆萨谷地的现代聚落供水，以及满足不断增加的游客用水。这里是《出埃及记》17:7 所说的摩西用拐杖敲击地面出现泉水的地方。一条水渠沿着穆萨谷地的走向，把穆萨泉水运送到 8 公里外的市中心，最后继续到达叙亚赫谷地。修建之初，这条水渠是开敞式的，宽 2.5 米，深 1 米，并从两公里长的峡谷小道通过。现在，这条水渠躺在纳巴泰人和罗马人铺设的地板之下；在纳巴泰时期，它就已经被一条干净的水渠代替了，这条新水渠是在峡谷小道北侧的岩石表面开凿出来后铺设的赤陶管道。水渠沿线设有四个沉淀池，用于过滤水中的淤泥，稳定水流。 今天，石凿的水渠和赤陶管道的残骸在齐腰高的地方依然清晰可见，很多顺着峡谷小道走下来的游客都亲眼目睹，并且做了评价。曾经在佩特拉进行过挖掘工作的宾夕法尼亚州立大学的利•安•贝达尔（Leigh-Ann Bedal）教授提醒我们，古代来到这个城市的人根本看不到管道，因为管道都被灰泥封在了石头水渠中。但是，我们可能会错过另一种体验，而且这种体验可能会对刚刚穿过干燥的沙漠进入佩特拉的人产生一种深刻的影响。贝达尔是这样描述的：“水在密封起来的沟渠和管道中流淌，潺潺的水声从峡谷小道高耸的石壁上不断传来，过路者虽不见其影，却一定能闻其声。” 除了用于止渴，音乐般的流水声对纳巴泰人及其客人蕴含着另一种意义。尽管我们缺少明确的书面证据，但是在纳巴泰地区，特别是佩特拉，水似乎被赋予了一种宗教意义。在峡谷小道的入口处，有三块巨大的“神石”，这些非人形的石头代表了纳巴泰的神，看护着佩特拉的水源。整个佩特拉共有 25 块神石，许多都位于跟水源有关的关键地方。沿着整个峡谷小道，有无数个宗教壁龛和雕刻，沿途潺潺的流水声也许是这里举行的宗教仪式的一部分。最引人注目的一块浮雕中有两头骆驼，骆驼面对面，由一位男向导牵着。骆驼是立体雕刻上去的，只剩下了下半部分，腿部保存得完好，后面是流淌的沟渠。刻画的骆驼是否用来运送货物，考古学家的意见存在分歧。人们通常认为浮雕表现的是重要的商队贸易，但是贝达尔认为骆驼属于宗教仪式队列的一部分，可能是被牵去当做祭品，而且在骆驼之间曾经有一个祭坛——就在咕咕流淌的水渠前面。 要把峡谷小道既作为输送穆萨泉水的通道，又作为定期、安全进入城市的通道，纳巴泰人必须把穆萨谷地的河水引到别处，因为在冬季降雨之后，会断断续续暴发大洪水。为此，他们修建了一座水坝和一条 40 米长的隧道，把洪水引到了穆斯里姆谷地（Wadi Muthlim）——这里也矗立着一块守护的“神石”。碑刻显示，主持修建水坝的人可能是国王马里丘斯二世（公元 40—70 年），也可能是国王拉布艾尔二世。今天，游客要越过水坝才能进入峡谷小道，但是也可以选择沿着隧道和穆斯里姆谷地进入佩特拉市中心，这样就会从贾贝尔—哈伯萨山（Jebel al-Khubtha）的南侧绕过，这座山的北坡分布着挖凿的王室坟墓。 1963年有人这样描述水坝和隧道对于沿着峡谷小道进入佩特拉市的意义：一群法国游客来旅游时，隧道已经堵塞了很久，这时穆萨谷地突发洪水，洪水无法进入隧道，只能冲向峡谷小道，结果这些游客被洪水夺去了生命。现在隧道又可以发挥作用了，但是水还是能够通过水沟进入峡谷小道，水可以达到踝关节那么深。很多侧面的小谷地和水道仍然被最初的纳巴泰水坝拦着，其中一些水坝上可以看到游人攀爬的痕迹。