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之所以很多科学家斩钉截铁地认为异形是“人工干预”的产物，都因为在“普罗米修斯事件”和“第一次异形事件”中扮演了重要角色的巨人族。
一、邪神的货舱
巨人族巨大的飞船被人类命名为“邪神”，英文名Juggernaut，一般用于对令人恐慌敬畏崇拜的巨大物体的形容，但是，真正令人恐慌的并不是这艘凝聚了巨人族科技的飞船，而是飞船中那些致命的“货物”。
1. 第一次异形事件
“我们在飞船内部的转盘上发现了一个巨大的外星生命体，已经死亡很长时间。其胸部有一个大洞，肋骨和宇航服向外弯曲，似乎什么东西从里面出来了。在转盘附近，有一个似乎被酸液腐蚀过的大洞，存放着数以千计的卵形物体。”
——达拉斯（“诺史莫号”船长），《飞行日志》
维兰德-汤谷公司官方记录里首次发现异形卵，就是在邪神的货舱中，再让我们倒回30年前，LV-223星球上的邪神飞船里面存放的货物。
2. 普罗米修斯事件
“这里就像一个基地，至少有五个一模一样的工程师建筑遗迹（邪神飞船）。我们进入其中之一，在暗处刻满图腾和神像的巨大房间内，整齐摆放着数百个滑石安瓿瓶 。这些容器对环境非常敏感，当我接近其中一个时，其顶部立刻溢出黑色的液体。”
——“戴维8”（仿生人，“普罗米修斯号”科考队顾问）
“戴维8”随后的日志记录道，那个神殿中的安瓿瓶不过是冰山一角，在邪神飞船的货舱中，就是LV-426星球那艘飞船的同样位置，堆放着数十万个这种容器。
3. 相关疑点
虽然两起事件都没有直接显示异形是由巨人族制造的，却引起了人们对邪神飞船货舱的疑问：
首先，安瓿瓶中存放的物质被证明是一种极具危害性的化学试剂——“黑水”，由巨人族研发，目的是毁灭人类。在邪神飞船飞往地球之前，“黑水”无意中泄漏，导致LV-223上的巨人族被屠杀殆尽。
其次，LV-426上的坠毁飞船货舱中的异形卵排放整齐，是有意被存放在飞船之内。
两艘巨人族飞船中，先后发现了这两种不同的货物样品。其中LV-426上的异形卵要被运往何方不得而知。
4. 时间差
LV-223上发现大量巨人族的遗骸，通过同位素检测，他们至少已经死了2000年。
LV-426上那位死亡的巨人族没有确切的死亡时间，但其遗骸已呈化石状，说明死亡时间可能要比LV-223上的巨人族要早。至少在安瓿瓶被搬上LV-223之前，异形卵已经存在了。而关于异形起源的第二个契机，就是安瓿瓶中的“黑水”。
二、“黑水”与神仆
在“遗失档案”被发现之前，神仆被认为是异形的起源，也被称为“始祖异形”。
1. “黑水”
神仆来自巨人族安瓿瓶中的“黑水”，“戴维8”对“黑水”的现场观察记录中提到：
“‘黑水’被盛放在四个锥形容器内，为保证‘黑水’长时间的活性和传染性，外部由滑石造的圆柱形安瓿瓶封盖，便于存放。每个安瓿瓶之间的距离相当精确，为0.9652米，一旦距离改变，就会加剧‘黑水’的不稳定性。可见，安瓿瓶对环境非常敏感，温度和空气流动发生变化，很容易导致‘黑水’泄漏。”
在“普罗米修斯计划”发回地球的各项研究成果中，科学家发现了维兰德公司对“黑水”成分的研究数据，由“戴维8”的“黑水”研究和翻译巨人族的实验报告汇编而成，这大概是该事件唯一幸存于世的资料了。
“黑水”又被称为黑色基因，学名“化学试剂A0-3959x.91-15”，是巨人族研制的生物兵器。这是一种对生物体污染能力非常强的活性基因液体，一滴液体中就含有数以亿计的突变微生物，对生命体具有致突变作用。目前仅仅了解两种致突变方式：
●摄入液体。
●吸入挥发气体。
哪怕只有一滴，黑色基因将完全侵蚀受害者。破译巨人族的实验报告显示，他们曾对两个实验星球“1-α星”和“3-γ星”上的生物进行“黑水”感染实验，对比结果如下：
