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美国卫生研究所（NIH）和英格兰卫生局多次指出：孕妇或者希望怀孕的女性应该努力戒酒饮酒。尤其是在怀孕初期，这一点更为重要的，因为饮酒会增加流产的可能。酒精可能会使得新生儿患上致命的"酒精综合征"。患有酒精综合征的婴儿体重会很轻，他们会出现吮吸、睡眠、视觉、听觉方面的障碍，还会在方向感、简单事物学习和注意力方面有问题，他们需要特别的老师和学校，并在与人相处和控制自己行为等方面存在困难，并且需要终身进行药物治疗。 英国卫生部提醒孕妇要注意：(1)避免食用松软的奶酪、土豆沙拉、卷心菜沙拉、即食食品和反复加热的食品，因为这些食物中含有的细菌有导致流产的风险；(2)避免食用半熟鸡蛋、蛋黄酱和未熟透的肉，因为它们可能含有沙门氏菌；(3)避免食用未洗的水果、蔬菜以及未经煮沸的牛奶和奶酪，它们都可能被弓形虫所污染；(4)避免服用高剂量的维生素A；(5)一周不要吃多于两块的脂肪多的鱼类，因为可能含有二恶英和多氯联苯；(6)避免食用鲨鱼和箭鱼，因为它们可能含有高水平的汞；(7)避免从咖啡、茶、可乐和巧克力中摄取多于300毫克的咖啡因；(8)避免登山和乘坐热气球，因为氧气含量的改变可能会引发早产。 很长一段时间以来，人们认为咖啡对孕妇有不良影响，可能导致婴儿体重过轻甚至流产。的确，对于孕妇来说，幸福和健康比其他一切都重要。对于有计划的怀孕，应尽早开始产前保健，停止有潜在危害的药物治疗和行为，比如药物和酒精的摄入，吸烟以及化学物质的接触。假如意外怀孕的话，要咨询医生是否需要在妊娠早期终止妊娠。每年在美国出生的婴儿中，大约每33个婴儿中就有一个有出生缺陷。而一岁以下婴幼儿的畸形和发育障碍比例为7%。学龄儿童的这一比例升至12%-14%，而18岁时这个数字将上升到17%。出生缺陷是导致婴儿死亡的直接原因，占所有婴儿死亡病例的20%。大多数畸形并非有遗传性，只有不到三分之一的病人会咨询出生缺陷是否与遗传有关。先天性畸形中只有大约10%是由畸形胎儿造成的。我们并不知道大多数出生缺陷的原因，但可以预防某些先天缺陷。母亲体内足够的叶酸可以防止大脑和脊柱的出生缺陷，即神经管缺陷（NTD)。女性在怀孕前需要每天摄取叶酸，这也可以帮助防止胎儿畸形。在美国销售的叶酸和多种维生素片全部都满足叶酸的每日需求。另一种获得足够叶酸的方式就是每天食用谷类早餐。 考虑到咖啡在孕妇人群中的广泛消费，咖啡因科学家开始评估其对孕妇的风险。在20世纪90年代早期，大量的文章对基于动物研究所得出的咖啡因和高剂量咖啡因对动物具有致畸作用存在怀疑。因为人类和动物毕竟有区别，尤其是在怀孕期间。许多女性在怀孕期间饮用含咖啡因的饮料，估计摄入量为144毫克/天，或者对于一个60公斤的妇女来说摄入量是2.4毫克/千克。尽管如此，也没有听说出现"咖啡因致畸综合征"，因此没有确凿证据表明咖啡因或咖啡对胎儿的致畸作用。 一些加拿大科学家在对基于人类研究的大量资料进行调查后，于2006年得出结论称，健康成年人每天咖啡因摄入量达到400毫克，不会影响人们的心血管、骨骼状态和钙平衡，不会改变人的行为、不会增加癌症的发病率，也不会影响男性生育能力。不过，育龄女性和儿童仍然属于"风险人群"，需要减少咖啡因的摄入量。根据现有的证据，建议育龄女性每天的咖啡因摄入量小于300毫克，儿童按体重计算每天的摄入量应小于2.5毫克/千克。 最近，纽约市卫生局环境和职业流行病学部门的布朗先生写了一份报告，这份报告是以MEDLLINE/PUBMED数据库里的流行病学研究为基础，把孕妇摄入的咖啡因作为接触致畸的主要结果。布朗得出的结论是，没有证据表明咖啡因有致畸作用。目前的流行病学研究中，没有充分证据可以表明，母亲摄入咖啡因可能导致婴儿先天性异常。另外有数据表明，孕妇饮用咖啡是没有风险的。一项研究也表明，适度地摄入咖啡因并不会导致婴儿早产或者出现低体重。 芝加哥西北纪念医院（NorthwesternMemorialHospital）妇幼药物专家玛丽莲·弗雷德里克森博士认为，孕妇在怀孕期间喝咖啡是没有问题的。开展这方面研究的丹麦流行病学专家波迪尔·海默·贝克博士说，丹麦国家卫生局建议，女性每天饮用咖啡应不超过三杯。贝克说"怀孕期间适度地摄取咖啡因并不会影响胎儿的生长。"丹麦研究人员招募了1200多名健康的孕妇，她们都承认在怀孕期间每天至少饮用三杯咖啡。她们分娩的婴儿的低体重或早产发生率与不喝咖啡的无明显差异，即使这些孕妇中有人一天喝咖啡超过七杯。需要指出的是，在这项研究里，作者将咖啡仅仅看做是咖啡因，而忽略了咖啡的不同种类和咖啡中含有的其他生物活性物质。最新的有关"女性摄取咖啡因及其可能产生的危害"的文献是在2002年出版的，出自波士顿哈佛医学院的利维顿博士和俄克拉何马州公共卫生学院的考文博士。 在进行了一番深入研究后，两位博士得出结论：并没有令人信服的证据表明摄取咖啡因增加了生育风险。在妊娠期间，咖啡因的摄入会在婴儿体重方面造成影响，但这种情况只发生在大剂量（一天饮用多于7杯）饮用的情况下，中等剂量并没有影响。到目前为止，所有值得信赖的医学数据都强有力地表明了，在妊娠期间，适度地摄取咖啡因不会对胎儿产生不良影响。不过，孕妇在怀孕后期必须减少咖啡的饮用量，因为咖啡因的半衰期在怀孕初期和婴儿快出生的这两个阶段较长。在缺乏进一步的研究可以证明咖啡对于孕妇来说是完全营养而安全的饮料之前，考虑到仍有医生和孕妇倾向将咖啡因和咖啡看做是妊娠的危险因素，所以对于孕妇来说，在怀孕期间最好将咖啡的饮用量控制在每天两杯之内。 畸形信息服务机构（OTIS）声明，没有证据表明咖啡因可以引起人类的出生缺陷。许多机构也像OTIS和孕妇风险机构一样，认为低剂量的咖啡因（150毫克/天)导致孕妇流产和婴儿低体重的几率非常小，几乎不可能。孕妇风险机构声明，只要孕妇的咖啡因摄入量小于每天150毫克（OTIS认为摄取咖啡因的适度剂量是每天300毫克），咖啡因就不会降低妇女的生育能力，也不会增加孕妇分娩出患有出生缺陷或其他疾病婴儿的几率。咖啡因可进入母乳中，高剂量的咖啡因可能导致婴儿睡眠时易醒和不安。美国儿科学会建议哺乳期妇女限制咖啡因的摄入量，但同时表示哺乳期的女性每天饮用一杯咖啡对婴儿不会产生危害。OTIS建议孕妇和哺乳期的妇女应该饮用足量的水、牛奶和果汁，并不建议取代所有含咖啡因的饮料。