有关六世活佛仓央嘉措的死因，外界一直众说纷纭。
1：病逝说：
【那一世 转山转水转佛塔 不为修来生 只为途中与你相见】
拉藏汗和桑结嘉措的宫廷血斗之后，拉藏汗斩首了桑结嘉措，并且下一个目标就是诬告仓央嘉措勾结新疆的准格尔人，还说他不是真活佛希望朝廷下令就地处死他。康熙帝下令让他把仓央嘉措押到京城来。结果，走到青海湖畔，仓央嘉措就病死了。
2：谋杀说：
【那一天 闭目在经殿香雾中 蓦然听见 你颂经中的真言】
谋杀一说的凶手自然就是拉藏汗，他之所以这样做是怕夜长梦多出现变数，同时也想自己的地位早点稳固，于是一不做，二不休，杀了仓央嘉措。
3：营救说：
【那一刻 我升起风马 不为乞福 只为守候你的到来】
当时的准格尔部和仓央嘉措的关系还是不错的，当听说他要被押到北京去时，准格尔部人认为这一去凶多吉少，而且当时藏族人也很喜欢仓央嘉措，都把他看成真正的活佛。仓央嘉措被准格尔人成功营救之后开始云游四方，四海为家。
4：囚禁说：
【那一年 磕长头匍匐在山路 不为觐见 只为贴着你的温暖】
也有人说仓央嘉措实际被秘密押解到了京城，康熙这么做是为了保持蒙藏稳定，这一点和囚禁鳌拜也很类似。
5：香巴拉：
【那一瞬，我飞升成仙，不为长生，只为佑你平安喜乐】
相对于前面几种说法，本书最后一种香巴拉传说显得更为神奇。香巴拉是一个地名，它是西藏的一个世外桃源，你也可以理解为天堂。传说当时押送仓央嘉措时，跟随他的有5个人，这些人为了不让真正的活佛死去就带着他逃向了荒原，因为他们相信荒原里有一个神秘的香巴拉。
他们没有找到香巴拉，但是却找到了几个山洞，那5个人里也仅存活下来了一对猎人父子，他们守护着仓央嘉措，并且一代代的传承，直到他死去。
他们达到的地方十分神奇，充满了资源和财富，并且与世隔绝。周围是美丽而宁静，脱离纷争的仓央嘉措就在这里潜心修行，他为这里去了一个名字叫：噶拉巴，后来这里也就成了香巴拉的都城。